日本选举制度采取由选民自行填写的「自书式投票」，随著立宪民主党与公明党突然合并，成立新政党「中道改革联合」，本次众院大选出现投票方式与有效票认定的疑问。
日本投票所原则上于上午7时开放、晚上8时关闭；不过，各市区町村的选举管理委员会如果有特殊情况，可以在一定范围内调整，关闭时间只能提前、不能延后。这次众院大选由于时逢严冬大雪，目前已有超过4成选管会回报将提前关闭投票所，开票作业预计最快9日中午才能全部完成。
根据日本总务省说明，日本选举采用「自书式投票」，也就是由选民亲自书写候选人姓名或政党名称。本次众议院议员总选举，包含单一选举区与比例代表两部分。全国有295个单一选区，选民需填写自己选区的「候选人姓名」，由最高票的一人当选；比例代表则分为11区，由选民填写「政党名称」，依据政党票多寡决定席次分配。
至于书写方式，全称、简称甚至暱称大致上都被认可，只要「能够明确辨识出是哪位候选人」，即可被认定为「有效票」。不过，最终决定权在各开票所的「开票管理者」，并没有完全统一标准。
如果出现同姓或同名，只写姓或名没办法判断投给谁。这种情况下，这些不明归属的票，会依据各候选人的有效得票比例进行比例分配。
日本经济新闻报导，2001年参议院选举投票时，曾有一些暱称被认定为有效票，像是把代表自由连合参选的前职业摔角选手佐山聪，写成「初代虎面人」。
不过，比例代表投票中，中央选举管理会会事先公告各政党的正式简称，要填写公告中的简称。由于中道由「立宪民主党」与「公明党」整合，总务省相关人士指出，如果以「立宪」或「公明」的旧党名投票，「最终判断交由各地方的开票管理者」，但「被判定为无效票的可能性相当高」。
1月28日开始「期日前投票」（提前投票）时，总务省也在X发文表示，「填写非名簿申报政党的政治团体名称或简称，依法将视为无效。」
不过，只要不写成立宪或公明，其他书写的认定方式则相对宽松。中道改革联合申报的简称为「中道」。总务省发文通知各地选管说明，只要填写正式名称或简称，甚至写成「中」、「中道改革」，包括平假名、片假名标示，也可视为有效。
虽然新党成立可能造成混乱，但基于投票的「自由与秘密」原则，选务人员无法在投票所点名特定政党，当场提醒选民注意。此次「中道」突然成立将造成何种结果，仍有待观察。
此外，在过去选举中，如果比例代表填写了「民主党」，会在「立宪民主党」与「国民民主党」之间按比例分配；但这次选举，这类选票会全部归给国民民主党。
除了有效票、无效票之外，还有一种是选票上什么也没写的「白票」，也就是废票。这类选票与没有投票的「弃权」不同，会被计入整体投票率。
每日新闻指出，近年日本的国政选举中，白票及填写候选人以外姓名的「无效票」大约在2％至3％左右。2024年上次众院选举，单一选区无效票为2.99％，比例代表为2.47％。
过去曾因为选民不满选举本身而出现大量白票的情况。2014年，当时大阪市长桥下彻为了推动「大阪都构想」，辞职后重新参选，主要政党都没有推出对抗候选人，投票率跌至史上最低的23.59％。
桥下最终虽然胜出，但白票占总投票数9.04%，包含白票在内的无效票更高达13.53％。白票数量甚至超越第2名候选人得票。
这次大阪府知事吉村洋文、大阪市长横山英幸同样为了「大阪都构想」辞职重选，同样面临主要政党不派候选人，最终的无效票比例也备受关注。
此外，还有一种状况，即使名字写对，也没办法被判定为有效票，那就是「该候选人属于其他选区」。
随著日本首相、自民党总裁高市早苗掀起「早苗旋风」，她在年轻族群中的知名度与支持度窜升，却也让部分首投族闹出笑话。
北海道一名网友在Threads发文说，就读大学的女儿和朋友相约期日前投票，5人全写下「高市早苗」，殊不知高市早苗虽然有参选，但选区是奈良2区，而「我们的选区是北海道1区」啊。