菲律宾外交部表示，菲律宾与中国正就海岸防卫队（海警）合作进行磋商，但澄清不涉及或在「敏感作业海域」的合作，包括联合巡航。
2024年6月，菲中双方在仁爱暗沙海域爆发严重冲突，造成一名菲律宾海军士兵断指。同年7月，两国于马尼拉召开南海问题双边磋商机制（BCM）第9次会议，议题之一即包括恢复中国海警与菲律宾海岸防卫队之间的交流。
中国驻菲律宾大使井泉日前在一场扶轮社演讲中透露，菲中海岸防卫队（即海警）合作备忘录已完成约95%的草拟，预计可在下一轮双边政治对话中签署。
然而，由于两国在南海仍不时发生摩擦，菲律宾坊间对于与中国签署此类合作文件抱持疑虑态度。菲律宾海岸防卫队发言人塔瑞耶拉（Jay Tarriela）20日更公开表示，海岸防卫队并未参与相关协商，特别是联合巡航行动。
面对外界反应，菲律宾外交部海洋事务发言人维拉纽瓦（Rogelio Villanueva Jr.）昨晚发布声明指出，菲律宾海岸防卫队与中国海警就在2016年即已签署备忘录，设立「海岸防卫队共同委员会」，双方自2024年开始讨论更新及修订这份文件。
维拉纽瓦澄清，磋商旨在重启「海岸防卫队共同委员会」，作为双方海岸防卫队的正式沟通管道，并未寻求在「敏感作业海域」展开合作，特别是联合巡航行动。
他强调，相关磋商都透过适当外交管道，并已通报所有相关决策部门首长，包括国家安全顾问、外交部长及菲律宾海岸防卫队司令。
维拉纽瓦强调，菲律宾在处理对中事务的立场一贯，「接触与提防乃相辅相成而非彼此矛盾」，马尼拉将在适当情况下持续推动「务实」的海事合作，同时坚定捍卫国家利益。
有观察人士指出，在南海议题上，菲律宾政府内部立场略有歧异。外交部倾向透过对话化解争议，而海岸防卫队与海军则对北京缺乏信任，强调建立吓阻能力与中国对抗。
为因应南海局势，菲律宾海岸防卫队与海军正积极与美国、日本、加拿大、澳洲、纽西兰等理念相近国家，定期在南海联合巡航演习。